各組、室業務職掌
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◇ 農村規劃組
一、農村發展與水土保持政策之研擬、協調及推動。
二、農村發展相關法規之研擬、修正、闡釋、協調及督導。
三、農地管理相關法規之研擬、修正、闡釋、協調及督導。
四、農地利用之協調、推動及督導。
五、農村發展相關之土地規劃與活化利用之協調、推動及督導。
六、農村閒置空間活化利用之規劃、設計、協調、推動及督導。
七、中長期計畫、方案與科技計畫之策劃、研擬及協調。
八、年度公共建設計畫先期作業與施政計畫之研擬、策劃、督導及評核管考。
九、農村發展與水土保持業務之宣傳、國際交流之規劃、推動及聯繫。
十、其他有關農村規劃事項。
◇ 農村建設組
一、農村建設相關計畫之策劃、推動、協調及督導。
二、農村整體景觀風貌營造與工程之調查、規劃、設計、協調及效益評估。
三、農村環境資源調查、生活品質與機能改善之策劃、協調、設計及評定。
四、農村生活環境改善工程之調查、規劃、設計及輔導。
五、農村基礎生產條件改善之調查、規劃、設計及輔導。
六、農村文化與景觀維護設施工程之調查、規劃、設計及輔導。
七、農村生態保育工程之調查、規劃、設計及推動。
八、農村友善環境工程之調查、規劃、設計及推動。
九、農村建設相關工程規定之研擬、修正及闡釋。
十、其他有關農村建設事項。
◇ 產業發展及休閒組
一、農村產業發展與休閒相關計畫之策劃、推動、協調及督導。
二、農村人力培育計畫之擬訂、規劃及協調。
三、休閒農業、農村旅遊與城鄉交流之規劃、推動及宣導。
四、休閒農業區之劃定、輔導與評鑑及休閒農場設置之審查、輔導及督導。
五、休閒農業公共建設之審查、輔導及督導。
六、農村文化技藝保存與應用之調查、策劃、輔導、協調及推動。
七、農村產業創新育成與經營發展之規劃、推動、協調及輔導。
八、農村社區綠色照顧之研擬、規劃、設計、推動及督導。
九、農村產業發展與休閒相關法規之研擬、修正及闡釋。
十、其他有關產業發展及休閒事項。
◇ 保育治理組
一、集水區整體調查、調適規劃之研擬及推動。
二、土砂運移觀測與收支之規劃、研究及發展。
三、工程構造物維護管理之規劃、研究及發展。
四、工程環境友善與減碳增匯措施之規劃、研究及發展。
五、水土保持與治山防災工程之規劃、設計、推動及督導。
六、大規模崩塌處理工程之規劃、設計、推動及督導。
七、韌性坡地保育措施之規劃、研究及發展。
八、農地水土保持與植生綠化工程之規劃、設計、推動及督導。
九、農村與防災道路系統工程之補助、規劃、設計、推動及督導。
十、其他有關保育治理事項。
◇ 坡地管理組
一、水土保持相關法規之研擬、修正、闡釋、協調及督導。
二、山坡地保育利用之水土保持管理規劃、協調、推動及督導。
三、山坡地開發利用水土保持計畫與其工程規劃設計之審查、檢查及監督；其完工設施調查之推動、執行及督導。
四、山坡地違規開發查報取締之規劃、協調、推動及督導。
五、特定水土保持區劃定、廢止、長期水土保持計畫與其治理工程規劃設計之審議、協調、推動、督導及管理。
六、山坡地範圍劃定、檢討變更與山坡地土地可利用限度查定分類之研擬、審議、推動及督導。
七、水土保持處理與維護相關工程之技術研發、修訂及推動。
八、工程品質管理與職業安全衛生之規劃、推動及督導。
九、工務處理、工程契約與施工規範之擬訂、協調及推動。
十、其他有關坡地管理事項。
◇ 減災監測組
一、土石流與大規模崩塌防災策略之規劃、推動、協調及督導。
二、土石流與大規模崩塌災害防救業務計畫及相關法規之研擬、修正、執行、推動及督導。
三、土石流與大規模崩塌災害整備、緊急應變運作、自主防災之策劃、協調、執行、推動及督導。
四、土石流與大規模崩塌、不安定土砂災害潛勢調查、監測之策劃、執行、協調及推動。
五、土石流與大規模崩塌、不安定土砂災害防減災工程先期規劃設計之策劃、執行及推動。
六、坡地與不安定土砂遙測技術、資料應用之規劃、研究、執行及推動。
七、本署資料開放盤點、品質檢核與加值應用推廣之規劃、協調及執行。
八、本署資訊管理、資通安全與資訊業務之分析、策劃、協調及執行。
九、本署資訊機房、網路系統與資訊設備之規劃及管理維護。
十、其他有關減災監測事項。
◇秘書室
一、印信典守及文書、檔案之管理。
二、法制、議事、出納、財務、營繕、採購及其他事務管理。
三、國會聯絡業務。
四、工友（含技工、駕駛）之管理。
五、不屬其他各組、室事項。
◇人事室
掌理本署人事事項。
◇政風室
掌理本署政風事項。
◇主計室
掌理本署歲計、會計及統計事項。